答案是肯定的，有区别，区别还不小。
财务外包是在西方发达国家发展较快的一种财务管理模式，主要是将整个财务管理活动根据企业的需要分解成若干模块，将这些模块中企业不擅长管理或不具有比较优势 的部分外包给那些在该方面居于行业领先水准的专业机构处理。
财务外包的具体形式包括：将财务资金管理外包给银行等金融机构管理、 将应收帐款外包给收帐公司去管理等。随着经济全球化的到来和互联网技术的高速发展。财务外包领域开始不断的拓展，不仅限于交易管理，还包括了财务分析、风险管理等，逐渐成为了增加企业活力的方式和进行业务转变的战略武器。
崇明代理记账的定义 《会计法》第36条明确规定：“不具备设置条件的应当委托经批准设立从事会计代理记账业务的中介机构代理记账。”代理记账是指将本企业的会计核算、记账、报税等一系列的会计工作全部委托给专业记账公司完成，本企业只设立出纳人员，负责日常货币收支业务和财产保管等工作。
代理记账机构不介入企业的经营，但代理记账机构可以提出建议。
总结：财务外包可以看做是代理记账的升级强化版，但两者的目标客户完全不一样，中大型企业更需要财务外包，小微型企业更需要代理记账。
然而从目前来看，代理记账仍然是中小企业财务外包的主流，更高层次的财务外包涉及较少。
两者具体的区别：
1、服务需求方的情况不同
代理记帐的服务需求方多为不具备设置会计机构与会计人员的企业。这在众多中小企业中比较常见。而财务外包的需求方的内涵更为广泛，不仅包括不具备设置会计机构与会计人员的中小企业，还包括大型企业，甚至是跨国公司，只有财务外包的打算和需求，都可以将企业的财务外包给其他单位和个人
2、服务内容不同
代理记账的服务需求方多为不具备设置会计机构与会计人员的企业，因此代理记帐的服务内容为需求方的全盘财务处理、代帐、报税。而财务外包的服务内容不仅可以是全盘财务外包，也可以是一个或是几个财务模块的外包，以及相关的财务分析等职能。
3、服务效果不同
代理记账的服务效果为服务成本小于企业雇佣一名财务人员而需支付的工资及相关费用。而财务外包带来的不仅是该类成本的节约，还能使企业减少潜在的服务成本，实现高绩效。财务外包能为企业提供各类税收合规的建议，降低企业税赋；又能引入管理会计的一些工具，为企业决策提供可靠而科学的分析性数据。
