与转让房地产有关的税金及附加的计算

提问来源：

纳税申报表的填报

综合案例

御筑房地产开发有限公司为自然人投资和控股的私营有限公司，2017年1月1日通过竞拍获得一宗国有土地使用权，面积46 860平方米，项目分三期开发，总可售面积为131 200平方米，其中“御筑苑一期”于2019年12月竣工验收，并已销售完毕，同月进行清算。

该公司本次清算土地增值税的“御筑苑一期”项目开发的商品房业态为非普通住宅和商业用房（非独立商业，俗称底商）。“御筑苑一期”占地面积15 551平方米，可售建筑面积37 634平方米，其中，非普通住宅可售建筑面积35 536平方米，商业用房可售面积2 098平方米；非普通住宅售价每平方米10 000元，商业用房（底商）每平方米15 000元。

提问：

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你好！有几个问题请教一下：

清算时，题目给出的条件：企业取得的增值税进项留抵税额大于销售收入的增值税销项税额

（1）企业取得的增值税进项留抵税额大于销售收入的增值税销项税额，说明土地增值税清算时，此时不用缴纳增值税，也就不用缴纳城建税，教育费附加和地方教育费附加。为什么在土地增值税清算扣除项目里要扣除预缴的城建税，教育费附加和地方教育费附加？

（2）土地增值税清算时，不用缴纳增值税。以前预缴的城建税，教育费附加和地方教育费附加是否可以找税务局退回？